排気口が下を向いていると、滑走路焼いちゃうからです。
また、ジェットエンジンは低速での推進効率が低いため、推力線を進行方向と平行にして、少しでも離陸時の加速を良くしようとしているわけです。
Schump

追加。
地面に当たって拡散した高熱のガスが後部胴体下面や尾輪を焼いてしまう、という問題もあります。
Schump